Trong tập phát sóng ngày 24 tháng 9 của show thực tế sống còn "Girls Planet 999", các thí sinh đã bước vào nhiệm vụ thứ 3 mang tên Creation Mission, cùng với đó là buổi công bố kết quả vòng loại trừ thứ 2. Có tổng cộng 43.648.173 phiếu bầu đã được người hâm mộ trên khắp thế giới gửi đến trong vòng này nhằm giành lấy cơ hội đi tiếp cho thí sinh mà mình yêu thích. 

Không giống như vòng loại đầu tiên nơi các thí sinh đón nhận kết quả đi tiếp hay dừng lại theo các Cell, vòng loại trừ thứ 2 lại được quyết định hoàn toàn dựa trên số phiếu bầu cá nhân của từng người. Chỉ những thí sinh đứng ở vị trí từ 1 đến 8 trong mỗi nhóm K, C, J mới có thể đi tiếp, đồng nghĩa với việc 30/54 thí sinh sẽ bị loại. Tuy nhiên, các Master được quyền cứu 3 thí sinh trong số những người bị loại bằng cách sử dụng Planet Pass. Vì vậy, sẽ có 27 thí sinh bị loại bên cạnh 27 thí sinh được bước tiếp vào vòng 3.

Dưới đây là danh sách các thí sinh giành quyền đi tiếp vào vòng 3 của "Girls Planet 999", được sắp xếp theo thứ tự phiếu bầu của họ:

K-GROUP:

1. Choi Yujin

2. Kim Chaehyun

3. Kim Dayeon

4. Kang Yeseo

5. Seo Youngeun

6. Guinn Myah

7. Kim Bora

8. Huening Bahiyyih

Planet Pass: Kim Suyeon

C-GROUP:

1. Thẩm Tiểu Đình

2. Tô Nhuế Kỳ

3. Hoàng Tinh Kiều

4. Thái Băng

5. Văn Triết

6. Trần Hân Uy

7. Phù Nhã Ngưng

8. Từ Tử Nhân *

Planet Pass: Châu Tâm Ngữ

* Mặc dù Từ Tử Nhân đủ điều kiện lọt vào vòng tiếp theo nhưng cô đã quyết định rút lui vì lý do sức khỏe.

J-GROUP:

1. Kawaguchi Yurina

2. Sakamoto Mashiro

3. Ezaki Hikaru

4. Nonaka Shana

5. Nagai Manami

6. Kishida Ririka

7. Ikema Ruan

8. May

Planet Pass: Kamimoto Kotone

Có một điều khá ngạc nhiên là danh sách 24 thí sinh được bước tiếp vào vòng 3 (không kể đến 3 gương mặt nhận được Planet Pass) lại giống 100% với những gì mà người hâm mộ đã soi được từ teaser trước đó của Mnet. Tất nhiên, suy đoán khi đó không liệt kê chính xác thứ hạng của từng người nhưng đây cũng là bằng chứng cho thấy trình soi của các fan có thể đáng sợ đến mức nào.

Kết quả TOP 9 trong vòng loại thứ 2 (với tỷ lệ 2 Hàn - 4 Trung - 3 Nhật):

1. Thẩm Tiểu Đình (C-GROUP)

2. Kawaguchi Yurina (J-GROUP)

3. Sakamoto Mashiro (J-GROUP)

4. Ezaki Hikaru (J-GROUP)

5. Choi Yujin (K-GROUP)

6. Tô Nhuế Kỳ (C-GROUP)

7. Hoàng Tinh Kiều (C-GROUP)

8. Thái Băng (C-GROUP)

9. Kim Chaehyun (K-GROUP)

Danh sách 27 thí sinh bị loại khỏi "Girls Planet 999" sau vòng loại thứ 2:

Kim Doah

Jeong Jiyoon

Đại Kiều

Lý Y Mạn

Kuwahara Ayana

Arai Risako

Hứa Niệm Từ

Sakamoto Shihona

Ngô Điềm Mật

Sakurai Miu

Choi Yeyoun

Kubo Reina

Dương Tử Cách

Huh Jiwon

Gia Nghi

Yamachi Moana

Lee Chaeyun

Lương Trác Oánh

Lee Hyewon

Ahn Jeongmin

Vương Nhã Lạc

Fujimoto Ayaka

Trương Lạc Phi

Hayase Hana

Yoon JiA

Shima Moka

Trong vòng loại trừ thứ 3, chỉ có 17 thí sinh với số phiếu bầu cao nhất được bước tiếp vào vòng thi cuối cùng. Tuy nhiên trong vòng này, sẽ không có bất kỳ giới hạn nào về việc bao nhiêu thí sinh K, C, J sẽ bị loại, tất cả sẽ hoàn toàn dựa vào thứ tự phiếu bầu của họ. Ngoài ra, các Master sẽ chỉ được cứu duy nhất 1 thí sinh thông qua Planet Pass. Như vậy, sẽ có 18 cô gái giành được quyền bước vào đêm chung kết để cạnh tranh cho suất debut trong girlgroup bước ra từ "Girls Planet 999".